01 września 1992 r.
proboszcz parafii pw. św. Kazimierza w Gdańsku-Zaspie, ks. Julian Noga, powierza misję utworzenia Szkoły Katolickiej przy Parafii pw. św. Kazimierza w Gdańsku mgr inż. Grażynie Kaniewskiej. Na początku szkoła zajmowała zaledwie kilka dawnych sal katechetycznych, jednak z każdym rokiem cieszyła się coraz większym zainteresowaniem rodziców ze względu na wyjątkową ofertę zajęć, które oprócz kształcenia dzieci zakładały ich wszechstronny rozwój: od rozbudzenia ciekawości otaczającego świata przez odkrywanie i rozwój własnych talentów po otwarcie się na świat wartości wynikających z wiary w Boga.
W roku szkolnym 1999/2000
zostaje utworzone Publiczne Katolickie Gimnazjum im. św. Kazimierza w Gdańsku, którego dyrektorem zostaje mgr Daniela Rutkowska, natomiast w roku 2003 z połączenia gimnazjum i Szkoły Podstawowej przy Parafii św. Kazimierza zostaje powołany Zespół Szkół Katolickich im. św. Kazimierza w Gdańsku.
03 marca 2002
poświęcenie sztandaru szkoły – ks. proboszcz Leszek Laskowski
12 października 2012
XX lecie istnienia Szkoły Podstawowej przy Parafii św. Kazimierza w Gdańska
23 maja 2018 r.
jubileusz XXV lecia szkoły. Uroczysta Msza św. odprawiona pod przewodnictwem ks. bpa Wiesława Szlachetki
31 sierpnia 2019
zostają wygaszone gimnazja. Wraz z tą decyzją przestaje istnieć Zespół Szkół Katolickich im. św. Kazimierza w Gdańsku, a szkoła ostatecznie przyjmuje nazwę: Katolicka Szkoła Podstawowa im. św. Kazimierza w Gdańsku.